设计grna网站新上映_grna scaffold(2024年11月抢先看)
biorxiv 分享一个上个月在BioRxiv上发表的CRISPR knockin协议。这个协议从gRNA设计、同源臂设计、克隆到编辑和选择都有详细的指导。最棒的是,作者优化了一系列的质粒,包括各种荧光标签、表位标签和TurboID。这些质粒设计了许多实用的酶切位点,方便根据需要进行替换和选择标记。这些质粒都可以在Addgene上直接购买。简直不要太方便! 砦谢Pelletier实验室,这对没有Knockin经验的学生来说真的是福音。如果你有Knockin的需求,强烈推荐看看这个协议。我自己还没用,等过一个月再来分享实际使用的感受! 协议的主要步骤包括: 设计gRNA和同源臂 克隆质粒 细胞培养 验证和选择 ️ 具体操作包括: 使用QIAGEN Plasmid Plus Midikit提取高质量的质粒DNA。 通过PCR扩增qTAG cassette,并使用Gibson Assembly进行四片段组装。 将组装好的质粒转入细菌中进行扩增,并使用QIAquick Gel Extraction Kit纯化质粒。 将纯化后的质粒转入细胞中进行编辑,并通过PCR和测序验证编辑结果。 这个协议不仅提供了详细的步骤,还解释了每个步骤的目的和注意事项。无论你是初学者还是有一定经验的科研人员,这个协议都能帮助你顺利完成CRISPR Knockin实验。
CRISPR筛选引领遗传干扰研究的新浪潮
《微生物学报》2024年9期出版
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CRISPR/Cas9攻略,科研必备! 听说大年三十还在刷科研帖的朋友,来年实验都会顺利哦! 一、实验原理 基因敲除:CRISPR/Cas9系统通过Cas9酶切割靶基因组,形成DNA双链断裂。通常情况下,细胞会通过非同源末端连接(NHEJ)方式修复断裂的DNA,修复过程中可能发生碱基插入或缺失,导致移码突变,从而使靶标基因失去功能,实现基因敲除。 基因敲入:CRISPR转录产生的gRNA介导Cas核酸酶靶向目标序列,进行切割。sgRNA识别并结合目标基因的靶向序列,形成RNA-DNA杂交,激活Cas9酶。Cas9酶作为DNA剪切酶,相对准确地切割目标DNA序列,donor DNA通过同源重组(HDR)将外源基因整合到切割位点,实现对基因组的编辑。 二、实验步骤 设计sgRNA:根据实验需求设计合适的sgRNA序列。 合成sgRNA:将设计好的sgRNA序列进行合成。 表达Cas9和sgRNA:将Cas9和sgRNA进行表达,通常通过载体进行。 切割目标基因:利用Cas9酶切割目标基因序列。 筛选单克隆:通过筛选获得含有编辑基因的单克隆细胞。 基因编辑结果验证:对基因编辑结果进行验证,确认编辑成功。 通过以上步骤,你可以实现对基因组的精准编辑,为科研实验提供有力支持。찟က
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