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qPCR实验全流程详解,轻松搞定! 详细讲解qPCR实验的原理和步骤,助你轻松掌握! 一、实验步骤: 1️⃣ 提取核酸:从目标样本中提取DNA或RNA。 2️⃣ 反转录(针对RNA样本):将RNA转录成相应的cDNA。 3️⃣ 预处理:纯化提取的DNA/cDNA,去除污染物。 4️⃣ 设计引物和探针:设计特异性引物和荧光探针,与目标序列特异性结合。 5️⃣ 准备反应体系:按照说明书要求,配制引物、探针、模板、聚合酶、缓冲液等。 6️⃣ 执行PCR循环:将反应体系装入热循环仪并进行PCR循环。检测DNA变性、引物结合、扩增和荧光信号等。 7️⃣ 数据分析:根据荧光信号的变化,分析Ct值,计算目标序列的相对数量。 二、qPCR原理: qPCR(Real-time Quantitative PCR)即实时荧光定量聚合酶链式反应(PCR),在PCR过程中加入荧光基团,根据荧光信号的变化实时监测扩增产物的变化。并通过Ct值和标准曲线的分析对起始模板进行定量分析。 实时荧光PCR的产物不同,主要方法分为三种: 1️⃣ DNA结合染料法:与双链DNA小沟结合的荧光染料,不与单链DNA结合,与双链DNA结合会发出荧光,从而进行实时监测。 2️⃣ 探针化学法:荧光标记的探针与靶序列特异性结合产生荧光信号,利用荧光信号实时检测PCR扩增产物的变化。 3️⃣ 淬灭染料引物法:使用荧光标记引物扩增,使荧光标记基因掺入到PCR扩增产物中,从而利用荧光能量共振进行传递。 篇幅有限,完整电子版请自行获取~
찟窠物理实验的常用仪器与软件一览 在基础物理实验室中,有许多常用的实验仪器和软件,帮助科学家们进行各种实验。以下是一些常见的实验方法和仪器: 基因鉴定:包括DNA提取、PCR体系、电泳技术等,用于研究基因敲除鼠、基因敲入鼠和点突变鼠等。 石蜡切片/冰冻切片:通过HE染色、免疫荧光和免疫组化等技术,观察细胞和组织结构。 qPCR:包括引物设计、RNA提取、逆转录和qPCR体系配置,用于定量分析基因表达。 Western blot (WB):从组织样本中提取蛋白质,通过制胶、电泳、转膜、孵抗体和曝光等步骤,检测蛋白质表达。 Elisa:用于微量蛋白或物质的定量分析。 细胞实验:包括细胞复苏、培养、传代、冻存、计数、转染以及细胞增殖/毒性实验、迁移实验、成管实验、免疫荧光染色、流式细胞术、细胞能量代谢实验、细胞周期检测实验和细胞凋亡实验等。 常用仪器:如离心机、涡旋混匀仪、普通显微镜、荧光显微镜、共聚焦显微镜、酶标仪、PCR仪、荧光定量PCR仪、流式细胞仪和海马仪等。 常用软件:包括统计软件如ImageJ、GraphPad Prism和SPSS,文献管理软件如EndNote和Zotero,绘图软件如Draw.io和PS,以及引物设计软件如Primer Premier 5和SnapGene。 通过这些仪器和软件,科学家们可以进行各种物理实验,探索自然界的奥秘。
젒T-PCR实验全攻略:从原理到实践 目录 cDNA与反转录 RT-PCR原理与目的 RNA抽提与质量检测 反转录过程 PCR程序与引物设计 PCR酶与体系 PCR产物检测 实时荧光定量PCR(RT-qPCR) 常见问题与注意事项 젣DNA与反转录 cDNA(互补DNA):与RNA链互补的单链DNA。在适当引物的存在下,由DNA聚合酶即反转录酶合成的单链DNA就是cDNA。 反转录(Reverse Transcription):在反转录酶的作用下,以RNA为模板合成DNA的过程。合成的DNA链称为与RNA互补的DNA,即cDNA。 젒T-PCR原理与目的 原理:RT-PCR全称反转录聚合酶链反应(Reverse Transcription-Polymerase Chain Reaction),将RNA的反转录和cDNA的聚合酶链式扩增(PCR)相结合的技术。 目的:检测核酸的表达,主要是RNA的表达。DNA不需要反转录的过程,直接PCR检测即可。 젒NA抽提与质量检测 RNA抽提方法:TRIzol法。主要成分包括苯酚,用于裂解细胞和变性蛋白。 RNA质量检测:分光光度计测定、凝胶电泳法。 젥转录过程 以RNA为模板合成cDNA的过程。在这个过程中,遗传信息的流动方向与转录时相反,因此称为“反转录”。需要反转录酶,合成的DNA称为与RNA互补的DNA(cDNA)。根据不同情况选择不同的反转录引物。 점CR程序与引物设计 PCR程序:三步法,包括变性、退火和延伸三个基本反应。 引物设计:找到目的基因的CDS序列,用软件设计和评价引物,并使用BLAST进行引物特异性检测。引物长度为15-30bp,最常用的为23bp;引物Tm值介于62-73℃之间,上下游引物Tm最好相近以保证其能高效工作;3'-端的Tm值要低于5'端;引物GC含量约为40-60%;避免扩增模板的二级结构域;避免引物的二级结构;避免与靶DNA错配。 점CR酶与体系 PCR酶:可选择普通的Taq酶、可扩增长片段的Taq酶或高保真酶。 PCR体系:按所选的PCR酶说明书来配制。 점CR产物检测 一般采用琼脂糖凝胶电泳,必要时也可使用聚丙烯酰胺凝胶电泳。 젥𖨍祅定量PCR(RT-qPCR) 基本原理:在PCR体系中加入能够指示DNA片段扩增过程的荧光染料或荧光标记的特异性探针,通过对PCR过程中产生的荧光信号累积或荧光标记的特异性探针释放的荧光信号进行监测和记录,实时监测整个PCR进程,再结合软件对获得的荧光信号数据进行分析,计算待测样品中特定DNA片段的初始量。 扩增过程:包括荧光背景信号阶段、荧光信号指数增加阶段和荧光信号平台期阶段。 常见问题与注意事项:在进行RT-PCR实验时,需要注意实验条件的选择、引物的设计、RNA的质量控制以及实验操作的规范性等问题,以确保实验结果的准确性和可靠性。
单基因携带者筛查的三大关键技术 在分子生物学领域,单基因携带者的筛查至关重要,它涉及到一系列先进的检测技术。以下我们将详细介绍三种主要的方法: 聚合酶链反应(PCR)슐CR 是一种强大的分子生物学技术,专门用于放大特定的 DNA 片段。通过设计针对特定基因的引物,可以在体外进行 DNA 扩增。实时荧光定量 PCR 是其衍生技术之一。 PCR 的应用非常广泛,例如,它可以用于检测囊性纤维化等单基因病的相关基因突变。通过分析扩增产物的大小和序列,可以确定是否存在突变。PCR 的灵敏度高、特异性强,操作相对简单,能够快速检测已知的特定突变。然而,它只能检测有限的突变位点,对于新的或未知突变可能无法检测。 桑格测序(Sanger sequencing)슦ᑦ 序是一种经典的基因检测方法,通过在 DNA 合成反应中加入不同的双脱氧核苷酸,使合成反应在不同位置终止,从而产生不同长度的 DNA 片段。这些片段通过电泳分离后,可以读取序列。 桑格测序的准确性高,是基因检测的“金标准”,能够检测已知和未知的突变。然而,它的成本相对较高,通量较低,不适合大规模筛查。在进行遗传性耳聋基因筛查时,桑格测序可以确定常见的耳聋相关基因是否存在致病突变。 下一代测序(NGS) NGS 技术包括全基因组测序(WGS)、全外显子组测序(WES)和目标区域测序等。NGS 技术能够同时对大量的 DNA 片段进行测序,产生海量的测序数据。 在单基因携带者筛查中,WES 和目标区域测序较为常用。它们可以检测多个基因的多种突变类型,包括点突变、插入/缺失、拷贝数变异等。NGS 的高通量和广检测范围使其能够同时检测多个基因,但数据分析复杂,需要专业的生物信息学分析能力。成本相对较高,对于某些低频突变的检测灵敏度可能较低。 基因芯片技术𛊥芯片是一种将大量已知的 DNA 探针固定在芯片表面,与待测样本中的 DNA 进行杂交的技术。通过检测杂交信号的强度和模式,可以确定样本中是否存在特定的基因突变。 微阵列芯片可用于单基因携带者筛查,例如检测地中海贫血、脆性 X 综合征等常见单基因病相关基因的突变。它可以同时检测多个基因的多个突变位点,通量较高,操作相对简单。然而,它只能检测已知的突变,对于新的或罕见突变可能无法检测。 这些技术各自有其优势和局限性,在实际应用中,需要根据具体需求选择合适的方法。
qPCR原理详解:实时荧光定量PCR 大家好,今天我们来聊聊qPCR(定量多聚酶链式反应)的原理。最近有点抑郁,加上药物作用,每天睡12小时,实在没精力更新。不过还是感谢大家的支持,下周有流式实验,到时候会拍操作界面的照片给大家详细讲解。 qPCR和传统PCR的主要区别在于检测方式。传统PCR只是对基因进行扩增,而qPCR则是实时检测底物的荧光强度来判断mRNA的表达量。这就引入了一个重要的概念:Ct值。 在qPCR中,基因的表达与荧光强度并不是线性关系,而是指数级增长(因为DNA的扩增是2^n次方)。因此,在某个循环时,荧光强度会达到一个阈值。当荧光强度超过这个阈值时,我们认为是高表达。到达这个阈值需要的循环数越少,基因的表达量就越高。这就是图2中曲线含义的解释(图片来源:Merck)。 有人可能会问,既然是mRNA的表达量,为什么说是DNA的扩增呢?这就要提到mRNA和cDNA的概念。空气中存在RNA酶,所以RNA在正常条件下极不稳定。即使是RNA-seq,也需要将RNA逆转录为cDNA。在生物学中,我们一般认为这两者的表达是一致的。 篇幅有限,下次再讲操作流程(RNA提取和引物设计等)。感谢大家的支持。
分子克隆实战指南:PCR篇 奈子克隆的目的是构建目的基因重组体,并在细胞中验证其成功过表达。以下是主要流程: 1️⃣ PCR:获取目的基因TP53基因的CDS区(1182bp),通过PCR并经琼脂糖凝胶电泳验证条带,然后胶回收目的基因。 2️⃣ 酶切:将目的基因与载体用特定限制性核酸内切酶切割,暴露粘性末端,并分别胶回收这两部分。 3️⃣ 连接:用DNA连接酶连接暴露粘性末端的目的基因和载体。 4️⃣ 转化:将连接成功的环状产物转化到大肠杆菌感受态细胞。 5️⃣ 涂板:12-16小时后挑菌做菌落PCR验证。 6️⃣ 摇菌:直接摇菌中提(见之前菌落PCR笔记,可以省去小提步骤)。 7️⃣ 提取质粒并测序。 8️⃣ 转染:将质粒转染细胞24小时后(记得要有对照组,即只转染试剂组)。 9️⃣ 提取细胞总RNA。 逆转录成cDNA。 1️⃣1️⃣ 设计qPCR引物(Primer bank查询即可)。 1️⃣2️⃣ 实时荧光定量PCR检测目的基因TP53。 ⚠️注意事项: 1️⃣ PCR试剂盒选择:实验室之前使用Takara的Primer star高保真酶,后期发现很多国货非常好用,如ATG巨匠生物的ATG 2*Proofast Master Mix,PCR结果稳定,酶高保真且扩增效率高。 2️⃣ PCR程序设定的两个关键问题: 退火温度:与引物性质有关,注意设计引物软件中的Tm值不应算上酶切位点和保护碱基,应只含互补配对部分,这时的退火温度才是准确的。理论上一定范围内,退火温度高时,特异性好。所以很多同学碰到有杂带的情况,可以适当提高退火温度;反之,如果条带不出,可以适当降低退火温度。 延伸时间:延伸时间与片段长度有关,还与酶的延伸效率有关,可以参见DNA聚合酶的说明书。 3️⃣ 通过胶回收获得的产物是未暴露粘性末端的双链DNA,所以还需要后续的限制性核酸内切酶进行酶切,将载体和目的基因片段都暴露粘性末端,才能进一步连接。
PCR技术全解析:从基础到实践 大家在做荧光定量PCR实验时,是不是经常感到困惑?今天我来给大家分享一些PCR的干货,帮助你们更好地理解这项技术! ➖➖➖➖➖➖➖➖➖➖➖➖➖➖➖► 1️⃣ PCR是什么? PCR全称是聚合酶链式反应(polymerase chain reaction),是一种非常强大的技术。它可以通过简单高效的方法复制DNA,就像是生物体外的特殊DNA复制。PCR的最大特点是能将微量的DNA大幅增加。 2️⃣ PCR是怎么完成扩增的? 通常一次PCR反应进行30-35个循环,2~3小时就能将待扩目的基因扩增放大几百万倍。是不是很神奇? 3️⃣ PCR实验原理图? 抱歉,这部分内容有点复杂,建议大家可以查阅一些专业的教科书或者在线教程,那里有更详细的解释。 4️⃣ 实验前需要准备什么? 在进行PCR实验前,你需要准备一些关键的工具和材料。比如,DNA聚合酶一般分为普通的Taq聚合酶和高保真性聚合酶。如果你只是想判断PCR产物是否存在特异性序列,普通的Taq聚合酶就足够了;但如果你想要得到没有任何突变的PCR产物,那就需要选择高保真聚合酶。需要注意的是,高保真的聚合酶所得的产物是没有A末端的,因此在T载体连接之前需要进行加A反应。或者直接选用普通的Taq聚合酶也可以。 5️⃣ PCR实验步骤是什么? PCR实验的步骤其实并不复杂,但需要一定的耐心和细心。具体的步骤包括:准备模板、设计引物、进行PCR反应、电泳检测等。如果你对某个步骤有疑问,可以在评论区告诉我哦~ 希望这些信息能帮到你们,祝大家在PCR实验中取得好结果!ꀀ
#实时荧光定量PCR系统设备# 【HM-P16】广泛应用于农业科学、药学、生物学等领域。该系统利用荧光探针发射特定波长和光谱范围的光,实时监测PCR反应过程中的荧光信号,实现对样品中特定物质的定量分析。具有高效稳定的控温能力,多通道、模块化设计,支持多种荧光方法和耗材,可同时检测多个样品,且分辨率高、灵敏度高、重复性好。实时荧光定量PCR系统设备为基因表达、突变分析、病原菌定量测定等研究提供了有力支撑,是推动分子生物学和生物医学发展的重要工具。
pcr技术的基本原理和过程 PCR技术就像科学界的魔法♂️,能在体外快速复制DNA! 娮馈们一起了解一下这项神奇技术的奥秘吧 它是如何把一小段DNA变成亿万个的呢? 快来看看吧✨ --- 一、 PCR技术基本原理 PCR(聚合酶链式反应)是一种神奇的生物技术✨,它能够快速扩增特定的DNA片段。 通过模拟DNA的天然复制过程,PCR让我们在实验室中实现了DNA的指数级扩增。 这项技术在分子生物学和医学研究中发挥着重要作用,让我来分享一些我对它的理解和经验吧! - 1️⃣ 模拟DNA复制 :我发现,PCR技术其实就是在模仿我们体内DNA复制的过程죀 它利用DNA聚合酶和特定引物,能够精准地找到目标DNA片段,然后开始复制✨。 就像是把一个故事复述多遍,让更多人知道一样,这样可以大大提高我们对特定基因的研究效率! - 2️⃣ 指数级扩增 :我的经验是,每完成一轮PCR循环,目标DNA的数量就会翻倍。 这意味着经过25-35次循环后,我们可以获得数百万倍的DNA量。 - 想象一下,这就像是种子在土壤里快速生长,一开始可能只有一颗,但最后却能开出满园花朵𘯼 - 3️⃣ 体外实现 :PCR技术最酷的一点就是它可以在体外进行ꣀ - 这让我想起了我的舍友,她在做实验时常常需要提取样本,然后用PCR来扩增那些微量的DNAᣀ 通过这种方式,我们能够更方便地进行基因检测、疾病诊断等应用,真的是太方便了! --- 二、 PCR技术过程 PCR技术的过程真的是一个神奇的旅程!✨ 它主要由变性、退火和延伸三个基本步骤组成,每一步都至关重要哦!ኦ发现,掌握这些步骤可以帮助我们更好地理解DNA扩增的奥秘! - 1️⃣ 变性阶段 :在变性阶段,我们把温度升到93-98℃,让DNA双链之间的氢键断裂,分开成单链!动🙤𘪨🇧若是把一条紧紧缠绕的丝带展开一样,瞬间变得松散! 我记得第一次看到这个反应时,心里真是惊叹不已,感觉科学如此神奇! - 2️⃣ 退火步骤 :接下来是退火步骤,我们会降低温度,让引物与模板DNA单链特定区域结合!銨🙥是拼图游戏中,将合适的拼块找到并放在一起,非常有趣!芦曾经在实验室里观察这一过程,看到引物精准地“找到了家”,那种成就感真是无与伦比! - 3️⃣ 延伸反应 :最后是延伸反应,在DNA聚合酶的作用下,以引物为起点合成新的DNA互补链! 这个过程让我想起了搭积木,每加一块,就能构建出新的结构,非常有趣!️ 我记得有一次实验中,看着荧光信号逐渐增强,那种激动简直无法用言语形容! --- 三、 PCR循环与扩增 PCR技术的循环与扩增是它的核心所在,这使得我们能够在短时间内获得大量的DNA片段。ᠠ 每一次循环都像是在为我们的研究铺路,让我们更接近目标。 在这里,我会分享一些我在实验室中的小发现和经验! - 1️⃣ 多轮循环 :在PCR过程中,我们通常需要进行25到35轮的循环,这样才能实现高效扩增。 我记得有次实验,我的同学小李就是因为没有控制好循环次数,导致结果不理想,真是让人心累呀! 所以,掌握好每一轮的操作是非常重要的!✨ - 2️⃣ 每轮增一倍 :每完成一轮循环,DNA片段的数量就会翻倍,这种指数级增长真的是太神奇了! 我之前做过一个小实验,从最初的几条DNA开始,经过几轮后竟然能得到数千条,感觉像是在看魔术一样!颜芭 这种特性让PCR成为了分子生物学中不可或缺的工具!ꊭ 3️⃣ 可扩增数百万 :通过多轮循环,最终我们可以实现数百万倍的扩增,这简直是太震撼了! 我姐姐在做基因检测时,就充分利用了这一点,让她能快速获得足够的样本量。젠 这种能力让我们在科研和临床应用中都能游刃有余,真的是个宝藏技术呢! --- 四、 PCR关键要素 在进行PCR实验时,有几个关键要素是必不可少的哦! 这些要素的搭配和选择直接影响到实验的成功率和结果的准确性。 接下来,我会分享我的一些经验,让你更好地理解这些关键要素的重要性!✨ - 1️⃣ 模板DNA :模板DNA就像是我们要复制的书本,提供了扩增的原始信息。 我发现,选择高质量的模板DNA能显著提高PCR的效率哦! 记得我的同学在做实验时,使用了污染的DNA,结果就是扩增失败了,真是教训深刻! - 2️⃣ 特定引物 :特定引物是PCR过程中的导航仪,它们帮助聚合酶找到正确的位置开始工作 我的经验是,引物设计一定要精准,这样才能确保扩增出你想要的目标片段죀 有一次,我设计了不够特异性的引物,结果扩增出了杂带,真是心累啊!銭 3️⃣ DNA聚合酶 :DNA聚合酶就像是我们的工匠,它负责将单链DNA拼接成双链 ️。 我发现,不同种类的聚合酶在温度适应性和扩增速度上都有差异,所以选择适合你实验需求的聚合酶非常重要⚙️。 记得我有次用错了聚合酶,结果反应效率大打折扣,真是一场“惨痛”的教训! --- 五、 PCR衍生方法 PCR技术的衍生方法让我们在基因检测和研究中如虎添翼! 这些创新技术不仅提高了检测的效率,还能实现更精确的定量分析。 今天我就来分享几种常见的PCR衍生方法,帮助大家更好地理解它们的应用!ᰟ - 1️⃣ 荧光定量PCR :荧光定量PCR(qPCR)是我特别喜欢的一种方法,因为它可以实时监测PCR反应的进程。 通过加入荧光探针,我们可以在扩增过程中获得准确的定量数据,真的是太方便了!✨ 我曾经在实验室用这个方法来检测基因表达,结果不仅快速,还特别精准,让我对实验结果充满信心! - 2️⃣ 数字PCR :数字PCR(dPCR)是个很酷的技术,它可以将PCR反应分散成多个独立的小反应单元。슨🙦 𗤸来,我们就能实现绝对定量,而不需要依赖标准曲线,简直是科研人员的福音! 我有个同学用这个方法研究稀有突变,结果超出预期,真让我佩服不已! - 3️⃣ 多重PCR :多重PCR让我在进行多个目标DNA段扩增时省时省力!⏳ 它允许在同一反应体系中同时扩增多个目标,这样不仅提高了检测效率,还节省了试剂和时间。ꊦ之前用这个技术同时检测几种病原体,效果非常好,让我感受到科技带来的便利! --- 总结与建议 PCR技术让我们在实验室里像巫师一样♀️, 轻松掌控DNA的复制魔法슦 论是科研还是医疗, 这项技术都发挥了不可替代的作用እ𘌦大家也能感受到这项技术的魅力✨
PCR失败常见原因及解决方法汇总 PCR(聚合酶链式反应)是一种广泛应用于分子生物学领域的强大技术,用于扩增特定的DNA片段。尽管PCR技术已经相当成熟,但在实验过程中仍然可能会遇到各种问题,导致实验失败。以下是一些常见的PCR失败原因及其可能的原因: 无扩增产物 늦衦🄎A浓度或质量不足:如果模板DNA的浓度太低或质量差,PCR反应可能无法进行。 引物设计不当:引物的特异性差或退火温度不合适,可能导致无法扩增。 反应体系中关键组分缺失或浓度不正确:如dNTPs、Mg2+、Taq聚合酶等。 PCR反应条件设置错误:如退火温度、延伸时间等。 实验操作失误:如污染样本或试剂。 非特异性扩增 引物设计不特异:引物与非目标序列有互补性。 模板DNA中含有杂质或抑制剂。 PCR反应条件不适宜:如退火温度过低。 Taq聚合酶活性不足或降解。 假阳性扩增 引物二聚体或发夹结构形成。 非特异性扩增产物的积累。 检测方法误读:如凝胶电泳条带误判。 假阴性扩增 ❌ PCR反应效率低下:导致目标片段扩增不足。 PCR产物降解或丢失。 检测方法敏感度不够:无法检测到少量扩增产物。 扩增效率低下 引物浓度不适宜:过高或过低都会影响扩增效率。 Mg2+浓度不合适:影响聚合酶活性。 Taq聚合酶选择不当:活性不足或稳定性差。 PCR循环次数太少:导致扩增不充分。 产物降解 存储条件不当:如温度过高或反复冻融。 酶的不稳定性:如Taq聚合酶活性下降。 反应体系中的核酸酶活性。 引物依赖性扩增 引物与模板DNA的非特异性结合。 引物自身的二聚体或发夹结构。 针对上述问题,可以采取以下措施进行排查和解决: 确保模板DNA的质量和浓度。 重新设计引物,提高特异性。 优化反应体系的组成和条件。 使用高质量的试剂和酶。 避免实验操作中的污染。 使用适当的检测方法,如实时荧光定量PCR,以提高检测的灵敏度和准确性。 定期校准设备,确保实验条件的稳定性。
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